Самолет-снайпер Су-39 предназначен для решения боевых задач на земле, море и в воздухе, выполнение которых другими ударными комплексами тактического назначения практически невозможно.Основные отличительные особенности:

- при активном противодействии средств ПВО противника круглосуточное, в простых и сложных метеоусловиях, с прицеливанием через бортовую оптико-телевизионную систему 23-х кратного увеличения или через радиолокационный прицельный комплекс:
- обнаружение и уничтожение с вероятностью 0,9 подвижных целей типа `танк`, `катер`, `вертолет`;
- самостоятельное обнаружение и поражение боевых кораблей от скоростного катера до эсминца;
- уничтожение современных комплексов ПВО в независимости от методов их работы;
- самостоятельная защита от атак истребителей и ведение с ними активного воздушного боя;
- высокая маневренность на малых и средних высотах;
- базирование на горных аэродромах с высотой расположения до 3000м;
- практически стопроцентная защита летчика и всех жизненно важных агрегатов самолета от их поражения стрелково-пушечным вооружением калибра до 30мм и его осколками.
Су-39 применяет:

Оружие класса `воздух-поверхность`:
- с точностью 0,5 м на дальности до 10 км ракеты с лазерной системой наведения и универсальное оружие самолета - ПТУР `Вихрь` (16 шт);
- ракеты противокорабельные, противолокационные, ракеты с телевизионной системой наведения;
- корректируемые бомбы с телевизионной системой наведения.

Оружие класса `воздух-воздух`:
- ракеты дальнего и ближнего боя с активными и полуактивными радиолокационными и пассивными инфракрасными головками самонаведения.

Неуправляемое вооружение:
- бомбы и реактивные снаряды, а также встроенная пушечная установка калибра 30мм.